微波加熱干燥殺菌有如下特點：
1、加熱速度快
常規加熱如火焰、熱風、電熱、蒸汽等，都是利用熱傳導的原理將熱量從被加熱物外部傳入內部，逐步使物體中心溫度升高，稱之為外部加熱。要使中心部位達到所需的溫度，需要一定的時間，導熱性較差的物體所需的時間就更長。 微波加熱是使被加熱物本身成為發熱體，稱之為內部加熱方式，不需要熱傳導的過程，內外同時加熱，因此能在短時間內達到加熱效果。
2、均勻加熱 常規加熱
為提高加熱速度，就需要升高加熱溫度，容易產生外焦內生現象。微波加熱時，物體各部位通常都能均勻滲透電磁波，產生熱量，因此均勻性大大改善。
3、節能高效
在微波加熱中，微波能只能被加熱物體吸收而生熱，加熱室內的空氣與相應的容器都不會發熱，所以熱效率極高，生產環境也明顯改善。
4、易于控制, 連續性生產
微波加熱的熱慣性極小。若配用電子控制，則特別適宜于加熱過程加熱工藝的自動化控制。轉速是連續可調的，廠家可根據不同生產工藝要求，進行工藝流程參數的調整。由于微波加熱與常規加熱不同，無慣性，反應速度快，可以做到即時控制，這樣可以減少廢品、次品率，提高經濟效益。
5、選擇性加熱
微波對不同性質的物料有不同的作用，這一點對干燥作業有利。因為水分子對微波的吸收最好，所以含水量高的部位，吸收微波功率多于含水量較低的部位這就是選擇加熱的特點。利用這一特點可以做到均勻加熱和均勻干燥。值得注意的是有些物質當溫度愈高、吸收性愈好，造成惡性循環，出現局部溫度急劇上升造成過干，甚至炭化，對這類物質進行微波加熱時，要注意制定合理的加熱工藝。
6、安全無害
在微波加熱、干燥中，無廢水、廢氣、廢物產生，也無輻射遺留物存在，其微波泄漏也確保大大低于國家制定的安全標準，是一種十分安全無害的高新技術。
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